Parte del territorio que hoy ocupa el municipio, fue habilitado de manera dispersa por núcleos de poblaciones indígenas Pames, Otomíes y Huastecos, los cuales por sus costumbres seminómadas y carácter belicoso, tenían poca interacción con la llegada de los españoles, estas poblaciones indígenas fueron diezmadas y segregadas a zonas serranas.

Sus casas estaban construidas con zacate, palma o xoxonato. Su comida ordinaria la constituía el maíz tostado (cacalextes), verduras de tierra y los animales que criaba la Sierra. Las mujeres vestían de enagua y huipil blanco y largo, prendas que ellas mismas tejían; los hombres se cubrían con mantilla (posiblemente utilizada como calzón) y un ayate; todos andaban descalzos. Se considera que el vestido pame es el común y corriente de los indígenas mesoamericanos.

                             _Chichimecas

La guerra entre los españoles y los indígenas se prolongó por más de dos siglos hasta que por el debilitamiento de los chichimecas a causa del hambre y la muerte, se logró la ocupación de la Sierra Gorda y la destrucción de la nación Jonaz por el coronel José de Escandón, quien fuera nombrado primer Conde de la Sierra Gorda. 

Con la envangelización llegan a la región los primeros misioneros agustinos, sin embargo, con la llegada de los fransiscanos, y de Fray Junípero Serra, la regíon experimenta un auge productivo económico, cultural y religioso, dejando como manifiesto de ello, cinco misiones fransiscanas, dos de ellas en el territorio de lo que hoy es el municipio.

       _{Fray Junípero Serra.}

Hasta el año de 1917, Landa de Matamoros, ocupaba un rango de Subdelegación de la municipalidad de Jalpan de Serra. A partir de ese año adquirió la categoría de Delegación y es hasta el 24 de Abril de 1941, se convierte en Municipio, siendo el Gobernador del Estado de Queretaro, el C. Noradino Rubio Ortiz.

  _{Noradino Rubio Ortiz.}